Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ZNF548Q8NEK5 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ZNF548Q8NEK5 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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