Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
USP30Q70CQ3 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
USP30Q70CQ3 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms