Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Q6P435 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Q6P435 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
Q6P435 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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