Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TPRNQ4KMQ1 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TPRNQ4KMQ1 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms