Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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PTPRNQ16849 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRNQ16849 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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PTPRNQ16849 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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PTPRNQ16849 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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PTPRNQ16849 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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PTPRNQ16849 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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PTPRNQ16849 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTPRNQ16849 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTPRNQ16849 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPRNQ16849 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRNQ16849 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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