Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ME3Q16798 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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ME3Q16798 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ME3Q16798 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ME3Q16798 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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ME3Q16798 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ME3Q16798 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ME3Q16798 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ME3Q16798 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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