Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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NFIL3Q16649 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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NFIL3Q16649 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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NFIL3Q16649 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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NFIL3Q16649 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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NFIL3Q16649 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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NFIL3Q16649 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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NFIL3Q16649 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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NFIL3Q16649 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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NFIL3Q16649 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFIL3Q16649 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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