Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
STX1AQ16623 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
STX1AQ16623 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
STX1AQ16623 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX1AQ16623 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
STX1AQ16623 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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