Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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EXT1Q16394 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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EXT1Q16394 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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EXT1Q16394 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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EXT1Q16394 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EXT1Q16394 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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