Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERPUD1Q15011 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HERPUD1Q15011 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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