Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SHPRHQ149N8 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
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SHPRHQ149N8 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
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SHPRHQ149N8 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
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SHPRHQ149N8 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
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SHPRHQ149N8 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
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SHPRHQ149N8 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
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SHPRHQ149N8 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SHPRHQ149N8 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
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SHPRHQ149N8 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
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SHPRHQ149N8 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
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SHPRHQ149N8 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
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SHPRHQ149N8 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
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SHPRHQ149N8 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SHPRHQ149N8 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
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