Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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