Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
RBM39Q14498 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RBM39Q14498 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.6 ms