Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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