Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
C1DQ13901 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
C1DQ13901 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
C1DQ13901 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
C1DQ13901 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C1DQ13901 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C1DQ13901 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C1DQ13901 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C1DQ13901 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
C1DQ13901 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms