Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PKP1Q13835 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PKP1Q13835 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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