Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CUL1Q13616 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CUL1Q13616 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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