Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
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SNX1Q13596 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SNX1Q13596 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
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SNX1Q13596 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SNX1Q13596 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SNX1Q13596 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SNX1Q13596 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SNX1Q13596 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SNX1Q13596 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
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SNX1Q13596 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNX1Q13596 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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