Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195 ms