Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SP140Q13342 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SP140Q13342 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SP140Q13342 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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SP140Q13342 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SP140Q13342 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SP140Q13342 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SP140Q13342 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SP140Q13342 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SP140Q13342 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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SP140Q13342 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SP140Q13342 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SP140Q13342 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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SP140Q13342 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SP140Q13342 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SP140Q13342 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SP140Q13342 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SP140Q13342 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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SP140Q13342 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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SP140Q13342 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SP140Q13342 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SP140Q13342 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SP140Q13342 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SP140Q13342 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SP140Q13342 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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