Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CALCOCO2Q13137 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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CALCOCO2Q13137 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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CALCOCO2Q13137 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CALCOCO2Q13137 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CALCOCO2Q13137 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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CALCOCO2Q13137 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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CALCOCO2Q13137 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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CALCOCO2Q13137 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CALCOCO2Q13137 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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