Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTENP60484 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTENP60484 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTENP60484 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTENP60484 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTENP60484 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTENP60484 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTENP60484 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTENP60484 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTENP60484 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTENP60484 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
PTENP60484 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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PTENP60484 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PTENP60484 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTENP60484 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTENP60484 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTENP60484 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTENP60484 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTENP60484 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTENP60484 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTENP60484 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTENP60484 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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