Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD10P28358 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD10P28358 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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