Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BRPF3Q9ULD4 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BRPF3Q9ULD4 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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