Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CITED1Q99966 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CITED1Q99966 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CITED1Q99966 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CITED1Q99966 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CITED1Q99966 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CITED1Q99966 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CITED1Q99966 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CITED1Q99966 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CITED1Q99966 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CITED1Q99966 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CITED1Q99966 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CITED1Q99966 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms