Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GPA33Q99795 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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GPA33Q99795 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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GPA33Q99795 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GPA33Q99795 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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