Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SEH1LQ96EE3 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SEH1LQ96EE3 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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