Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
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CCDC47Q96A33 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CCDC47Q96A33 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CCDC47Q96A33 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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