Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP53Q70EK8 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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USP53Q70EK8 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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USP53Q70EK8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
USP53Q70EK8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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