Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

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Length 1,092 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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USPL1Q5W0Q7 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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USPL1Q5W0Q7 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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USPL1Q5W0Q7 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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USPL1Q5W0Q7 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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USPL1Q5W0Q7 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USPL1Q5W0Q7 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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USPL1Q5W0Q7 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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USPL1Q5W0Q7 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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USPL1Q5W0Q7 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USPL1Q5W0Q7 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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