Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.1 ms