Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SP6Q3SY56 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SP6Q3SY56 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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