Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Q1T7F1 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Q1T7F1 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Q1T7F1 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Q1T7F1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Q1T7F1 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Q1T7F1 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Q1T7F1 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Q1T7F1 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.1 ms