Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.1 ms