Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTL8BQ17RB0 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
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RTL8BQ17RB0 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTL8BQ17RB0 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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