Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPROQ16827 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PTPROQ16827 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms