Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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RTN1Q16799 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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RTN1Q16799 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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RTN1Q16799 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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RTN1Q16799 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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RTN1Q16799 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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RTN1Q16799 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RTN1Q16799 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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RTN1Q16799 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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RTN1Q16799 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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RTN1Q16799 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RTN1Q16799 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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