Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLPPQ16740 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLPPQ16740 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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