Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
TBR1Q16650 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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