Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USF2Q15853 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USF2Q15853 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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