Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.97□□□□□ -2.56
NEDD8Q15843 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
NEDD8Q15843 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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