Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NPTX1Q15818 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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