Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDSNQ15517 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDSNQ15517 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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