Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
BRD3Q15059 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
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BRD3Q15059 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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BRD3Q15059 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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BRD3Q15059 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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BRD3Q15059 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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BRD3Q15059 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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BRD3Q15059 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
BRD3Q15059 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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