Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
LAPTM4AQ15012 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LAPTM4AQ15012 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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