Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SMC1AQ14683 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMC1AQ14683 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMC1AQ14683 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms