Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CUL3Q13618 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CUL3Q13618 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms