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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
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Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
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Ensembl Transcript ID
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Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
SNORD115-43-201
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82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-36-201
ENST00000365629
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.547-201
ENST00000384654
119 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.569-201
ENST00000384749
103 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNA5SP95-201
ENST00000410319
137 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
snoU13.16-201
ENST00000459350
104 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-897P-201
ENST00000517135
105 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.721-201
ENST00000517207
102 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC018659.1-201
ENST00000551083
169 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC124312.5-201
ENST00000604451
268 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD115-40-201
ENST00000606510
82 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.804-201
ENST00000615262
101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC243994.1-201
ENST00000618627
109 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
HOXA11-AS1_6.1-201
ENST00000620092
179 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-1272P-201
ENST00000362776
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-290P-201
ENST00000365212
101 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.509-201
ENST00000384506
99 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR548O-201
ENST00000408583
114 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC022028.1-201
ENST00000412054
408 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC098934.3-201
ENST00000430450
190 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC023449.1-201
ENST00000454464
154 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD77.4-201
ENST00000516158
81 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNA5SP220-201
ENST00000516298
104 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU7-25P-201
ENST00000516544
62 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU7-149P-201
ENST00000516739
59 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR4662B-201
ENST00000579498
81 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR5688-201
ENST00000580619
83 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
SNORD18A-201
ENST00000363753
72 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-326P-201
ENST00000365480
107 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.380-201
ENST00000365663
111 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.587-201
ENST00000391210
103 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-177P-201
ENST00000411257
104 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AC087499.4-201
ENST00000448505
178 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-229P-201
ENST00000516614
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-1223P-201
ENST00000517124
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
NPPA-AS1_2.1-201
ENST00000618496
149 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR369-201
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70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.28-201
ENST00000362554
111 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
Y_RNA.31-201
ENST00000362574
102 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-125P-201
ENST00000384505
107 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR573-201
ENST00000384964
99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR526A2-201
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65 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
TRAJ48-201
ENST00000390489
63 nt
APPRIS P1
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-121P-201
ENST00000410525
99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MRPS35P2-201
ENST00000508242
191 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RNU6-126P-201
ENST00000516685
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR5692C2-201
ENST00000577959
77 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AL355297.3-201
ENST00000604082
446 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
AP000753.3-201
ENST00000604083
169 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
RMST_2.1-201
ENST00000617263
136 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR6734-201
ENST00000621166
68 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
MIR5087-201
ENST00000635826
76 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL1
Q13616
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BASIC
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□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
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105 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
MIR1287-201
ENST00000408492
90 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
Y_RNA.602-201
ENST00000410535
92 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AC114737.2-201
ENST00000421583
173 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
MTATP6P23-201
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476 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU7-73P-201
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63 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AC107297.1-201
ENST00000459991
176 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU6-397P-201
ENST00000516226
104 nt
BASIC
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CUL1
Q13616
RN7SKP12-201
ENST00000516275
143 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU2-31P-201
ENST00000516954
155 nt
BASIC
0.46
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CUL1
Q13616
AC007991.2-201
ENST00000520185
102 nt
TSL 5
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AC007751.1-201
ENST00000529260
376 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AC011195.1-201
ENST00000578177
177 nt
BASIC
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CUL1
Q13616
AC012433.1-201
ENST00000588916
398 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AL512605.2-201
ENST00000592972
256 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AP000942.4-201
ENST00000604811
241 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
EVI2B-201
ENST00000330927
1999 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
SNORA63C-201
ENST00000364578
129 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU4-45P-201
ENST00000365469
141 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
SNORD24-201
ENST00000383884
75 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU6-945P-201
ENST00000383947
107 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU6-101P-201
ENST00000410323
104 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNA5SP247-201
ENST00000411181
105 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
MTCO2P12-201
ENST00000427426
682 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
UBE2WP1-201
ENST00000362030
340 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
MIR367-201
ENST00000362299
68 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
Y_RNA.14-201
ENST00000362415
103 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
SNORD115-28-201
ENST00000363931
81 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
Y_RNA.238-201
ENST00000364441
102 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
SNORA40.5-201
ENST00000391061
128 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU6-383P-201
ENST00000410864
94 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AC092628.1-201
ENST00000436250
252 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AC091959.1-201
ENST00000495857
238 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
MTCO2P24-201
ENST00000515611
426 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AC084365.1-201
ENST00000552470
310 nt
TSL 3
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
MIR4724-201
ENST00000579485
89 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
Z83818.1-201
ENST00000603584
150 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
Z97988.1-201
ENST00000637697
135 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
LRRIQ3-204
ENST00000395089
2673 nt
APPRIS P2
TSL 5
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
snoU2_19.2-201
ENST00000363024
80 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
Y_RNA.419-201
ENST00000384041
102 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU6-1237P-201
ENST00000384777
107 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
MIR548A2-201
ENST00000384956
97 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
SNORA53-201
ENST00000391141
249 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
RNU6-938P-201
ENST00000411285
103 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
CUL1
Q13616
AC244023.1-201
ENST00000426884
112 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
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