Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIPK1Q13546 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIPK1Q13546 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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