Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SF3B2Q13435 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF3B2Q13435 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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